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La ricchezza delle collezioni, che sono venute a formarsi nel corso di 130 anni, è tale da collocare il Museo Civico di Bolzano tra i più importanti musei nell'arco alpino. Vi è infatti compiutamente rappresentata sia la storia dell'arte regionale a partire dal primo Medioevo fino al XX secolo, che l'arte popolare dei secoli passati.
La maggior parte degli oggetti conservati al Museo è catalogata secondo le norme ministeriali dell'ICCD, ma il progetto di catalogazione non è ancora concluso.
Il catalogo è consultabile in loco, previo appuntamento.
Al Museo Civico sono conservate, ma non ancora catalogate, raccolte di fotografie storiche, sigilli, monete e carte geografiche, reperti archeologici.
